Las actividades del Instituto se desarrollarán a partir de la implementación de programas, los que serán presentados a través de proyectos en cada una de las áreas de interés costero, que son:
- Recursos costeros.
- Gestión costera.
- Recursos culturales.
- Turismo.
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Maricultura
El IDC desarrolla diversas actividades en el área de maricultura costera. Algunas actividades se desarrollan en el marco de la Red de fortalecimiento de la Maricultura costera Patagonica y otras son financiadas por otras fuentes